2007年在中国东部的太湖发生的大规模蓝藻爆发使两百万人受到了"饮用水危机" 的影响。流入太湖的大量“营养”污染物（氮、磷等）造成了蓝藻严重爆发，使无锡人的水龙头中流出带着腥臭味的绿色的水。这些流入太湖的污染物来自于农业、工业以及生活废水。其中，大量施用在农田里的化学合成肥料是“主犯”之一。这次水危机让无锡人深刻体会到了太湖污染的后果。历年来，政府对太湖污染的治理已经投入了几百亿的资金，2008年，太湖的情况又是如何呢？这一年，太湖蓝藻卷土重来，甚至比往年发生的更早。当绿色和平的工作人员看到太湖的蓝藻时，我们感到很痛心，但是并不意外。
化学农业（以来大量化学合成肥料和农药投入的农业生产方式）相关的藻类爆发事件不仅仅影响了太湖，也影响了中国其他地区的重要水系。例如：2008年6月，黄河流域最大的淡水湖——内蒙古乌梁素海——发生了严重的黄藻爆发，根本原因是河套平原灌区农田中流失的大量化肥，通过排干渠系统不断汇入乌梁素海造成的污染；安徽巢湖也是备受化学农业污染困扰多年的一个重要湖泊。
相关政府部门已经设计和实施了多项政策以应对农业污染。比如：鼓励生态农业，循环利用农业废弃物。另外，农业部从2005年开始推行一项全国性的化肥减量政策——测土配方施肥 ，项目实施三年后，全国已累计推广测土配方施肥面积达9亿亩次。
绿色和平在2008年3月至11月期间在太湖周边进行调查，以检验测土配方施肥在这一区域减少化肥用量、控制农业污染方面的进展。调查中，绿色和平的工作人员在直接流入太湖的两条小河采集了25批次水样，并访问了当地农民，记录他们施用化肥的时间、种类和用量。水样被送往实验室，检验其中与化学农业相关的总氮、硝态氮、总磷等物质含量。
水样检测结果显示，当地在开展测土配方施肥工作3年后，水污染依然严重。
20批次样品中的总氮浓度超过国家地表水Ⅴ类标准，其余5批次水样超过Ⅳ 类水标准。这就意味着水样采集地的水不能作为饮用水源地，也不适宜人体直接接触。超过Ⅴ类水标准的水，甚至不能用于工业生产和农业灌溉。硝态氮主要来自于化肥流失，水样检测结果显示在施用化肥后，由于降雨或者灌溉的冲刷作用，使水中含有高浓度的硝态氮。检测结果说明，化肥流失造成的农业污染仍是一个主要污染源。农民们也正是，他们的化肥施用量几乎比十年前增加了一倍。
太湖的农业污染仍旧是对无锡的一个威胁。农业污染，同样也是中国其他地方存在的问题。在2005年至2007年，测土配方施肥实施的三年中，每年的全国化肥施用量都要比上一年增加近200万吨（见下图）。与此同时，中国的化肥生产量也一直在上升。测土配方施肥项目开始于2005年，但是并没有给中国的化学合成肥料施用量带来拐点。大量的化肥仍旧在源源不断地进入水中造成污染，并最终危害人类自身。
| 年份 | 农用化肥生产量（折纯）吨 | 农用化肥施用量(折纯)吨 |
| 2002 | 37,910,000 | 43,394,000 |
| 2003 | 38,813,100 | 46,366,000 |
| 2004 | 48,048,200 | 46,366,000 |
| 2005 | 51,778,600 | 47,662,000 |
| 2006 | 53,450,500 | 49,277,000 |
| 2007 | 52,485,800(1月～11月） | 51,078,000（全年） |
| 2008 | 44,740,000（1月～9月） |
当政府投入大笔资金清理藻类时，真正的解决之道——生态农业——却没有得到足够的推广。
在太湖西岸的宜兴，有一个坐落在山脚下的美丽的村子。那里有200亩由“鸭子军团”守卫的水稻田。“稻田养鸭”是一种典型的生态农业模式。鸭子在稻田中放养，它们吃掉稻田里的害虫，杂草也被踩死或者吃掉。鸭子的游动将更多的氧气带入水中，让水稻长得更加强壮。有机肥和鸭粪为水稻提供了足够的营养。化学合成肥料和农药不再是必需品。
与“稻田养鸭”类似，还有很多种不同的生态农业模式可以让农民收获充足、安全的粮食，而且不必以破坏环境为代价。与测土配方施肥相比，生态农业不依赖化学合成肥料，而是充分利用牲畜粪便、秸杆等农业“废弃物”制造有机肥料和沼气。尽管已经有一些旨在推动生态农业的政策，但这些政策的内容和执行仍需细化和加强。需要有更多的财力、物力和人力支持生态农业的推动，让农民、消费者、环境都从中受益。
中国政府急需对测土配方施肥的效果重新进行评估，因为这项政策只是针对化肥使用者（农民）的，而且仍旧是以依赖化学合成肥料投入为基础。如果政府想要切实减少化肥的施用量，就需要制定针对化肥生产者的生产减量政策，这其中可以包括减少对化学合成肥料的生产补贴和优惠。另外，还需要制定一系列鼓励有机肥生产、推广和高效利用的激励政策。
没有更多的时间可以浪费了，中国农业急需从根本上转变农业生产方式。
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